Tecnologia enzimatica y biocatalisis para aplicaciones biotecnológicas

Mecanismos moleculares de tolerancia al estrés abiótico y biótico en plantas; Edicion génica para mejoramiento de caracteres de tolerancia a estrés o calidad en cultivos.

Principales líneas de investigación:
Estudio de los mecanismos de tolerancia al estrés ambiental y por patógenos en modelos vegetales evolutivamente distantes (briofitas y angiospermas).

Mejoramiento molecular de soja, con énfasis en tolerancia al estrés hídrico.

Mejoramiento molecular de plantas mediante edición genómica.

Análisis de los mecanismos de muerte celular programada en plantas modelo y sus implicancias en la tolerancia a enfermedades y a factores de estrés ambiental.

Bases moleculares de la respuesta de defensa vegetal frente a microorganismos patógenos.

Objetivos
1- Identificación y análisis funcional de genes y metabolitos involucrados en la resistencia vegetal frente a microorganismos patógenos.
2- Análisis de los mecanismos de resistencia de las plantas a enfermedades causadas por fitopatógenos con el fin de mejorar la resistencia activando los mecanismos intrínsecos de defensa.

Para ello se están utilizando plantas de interés agronómico y plantas modelo. Dentro de los patosistemas en estudio se encuentran: 1) papa y patógenos fúngicos, 2) soja y Diaporthe phaseolorum causante del cancro del tallo, y 3) las plantas modelo Arabidopsis thaliana y el musgo Physcomitrium patens y su interacción con una variedad de fitopatógenos incluyendo Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum, Botrytis cinerea, Pythium, Colletotrichum gloeosporioides y Alternaria sp.
Bases moleculares de la respuesta de defensa vegetal frente a microorganismos patógenos.

Metabolismo redox, bienergética, proteínas mitocondriales, enfermedades oxphos

El grupo desarrolla investigaciones en dos temáticas principales.

Por un lado, se trabaja en el estudio de bacterias patógenas de importancia agrícola, abarcando actualmente enfermedades que afectan a los cultivos de papa, tomate, cebolla y trigo. Se realiza un trabajo multidisciplinario en conjunto con investigadores de otras instituciones (Facultad de Agronomía, INIA, MGAP, INASE), con el objetivo de generar conocimiento y capacidades que puedan ser aplicadas al establecimiento de medidas efectivas de control para cada problemática abordada. Estos estudios implican el uso de diferentes actividades incluyendo el aislamiento de patóenos a partir de muestras de vegetales y del ambiente, identificación y tipificación molecular de las cepas, seguimiento del proceso de colonización y multiplicación in planta, evaluación de resistencia de materiales generados en programas de mejoramiento, y desarrollo de métodos moleculares de diagnóstico. También estamos incorporando abordajes masivos para el estudio de estas interacciones planta-patógeno, incluyendo análisis genómicos, transcriptómicos y metabolómicos. La experiencia y capacidades de trabajo generadas tienen el potencial de ser aplicadas al estudio de otras enfermedades de relevancia, atendiendo así a las necesidades que surjan desde el sistema productivo.
Por otro lado, más recientemente se trabaja en una nueva línea de investigación enfocada a la identificación de nuevos metabolitos microbianos de interés, con potenciales aplicaciones en salud humana, animal y de cultivos. Se parte de una colección de cepas de Streptomyces generada en trabajos previos del grupo. Dado el reconocido potencial de producción de compuestos bioactivos que presenta este género, se considera relevante desarrollar estudios en esta temática con el objetivo de valorizar los recursos microbianos disponibles. Se realizan diferentes screenings de actividad antimicrobiana, nematicida y de promoción del crecimiento vegetal, con el objetivo de seleccionar las cepas con mayor potencial. También se están utilizando herramientas de minería genómica para la identificación de los clusters genéticos responsables de la biosíntesis de metabolitos microbianos (BCCs) en las cepas de Streptomyces seleccionadas. El análisis genómico se complementa con estudios a nivel metabolómico para la comparación de perfiles de metabolitos producidos bajo diferentes condiciones y elucidación estructural de los metabolitos de interés. El grupo desarrolla investigaciones en dos temáticas principales.

Bioquímica redox

Principales líneas de investigación:
Bioquímica redox, en particular, bioquímica de tioles biológicos y su rol en procesos de señalización celular, detoxificación y antioxidantes.

Modulación redox de sirtuinas.

Procesos redox en envejecimiento de glóbulos rojos para transfusión.

Producción de radicales libres del oxígeno y nitrógeno y especies derivadas en sistemas biológicos. Diferencias en cuanto a reactividad con distintas biomoléculas, propiedades fisicoquímicas y comportamientos difusionales.

Bioquímica de tioles y sulfuro de hidrógeno.

Análisis y optimización de la conservación de glóbulos rojos para transfusión.

Estudio del rol de las especies reactivas del oxígeno y del nitrógeno en patología cardiovascular.

Las galectinas son proteínas que poseen un dominio de reconocimiento para carbohidratos con especificidad para beta-galactósidos. Participan en numerosos procesos biológicos tanto normales como patológicos, entre los que se encuentra el cáncer. Esto las convierte en un blanco prometedor para la terapia contra el cáncer y a sus inhibidores en potenciales agentes antitumorales. Las galectinas se unen a beta-galactósidos, en particular lactosa y N-acetil lactosamina (LacNAc) con una afinidad moderada, la que aumenta para ligandos multivalentes. Dado que síntesis química y quimioenzimática de ligandos multivalentes es compleja su obtención de fuentes naturales es una alternativa interesante. La lactoferrina es una glicoproteína presente en la leche de los mamíferos que contiene N-glicanos con alto contenido de manosa y N-glicanos complejos. Estos últimos presentan estructuras biantenarias conteniendo unidades de LacNAc, lo que las convierte en potenciales ligandos de galectinas. Dado que la misma se puede purificar del lactosuero, un subproducto de la industria láctea, constituye una fuente barata de glicanos.

El objetivo de este trabajo es la liberación enzimática de los glicanos de la lactoferrina, su purificación y análisis así como la evaluación de los mismos como inhibidores de galectinas.

Los glicanos presentes en glicolípidos y glicoproteínas participan en numerosos procesos fisiológicos. Por lo cual una alteración en sus patrones de glicosilación se traduce en enfermedades tales como desórdenes congénitos de la glicosilación, enfermedades autoinmunes, infecciosas o inflamatorias crónicas y cáncer. Los carbohidratos también se encuentran involucrados en procesos de infección parasitaria o viral, participando tanto en su propagación como en la evasión de la respuesta inmune del hospedero. Conociendo la estructura y función de los glicanos es posible comprender el rol que desempeñan en procesos infecciosos o en el desarrollo de algunas enfermedades, lo que permite el diseño de métodos de diagnóstico y tratamientos terapéuticos. Las glicosidasas inmovilizadas son herramientas excelentes para esta finalidad ya que hacen posible la remoción selectiva de glicanos sin alterar la estructura tridimensional de las glicoproteínas. Esto permite la evaluación de las moléculas deglicosiladas en procesos biológicos, de forma de determinar la relevancia del glicano removido en el mismo. Presentan como ventaja adicional su fácil remoción del medio de reacción y su reuso.

El área de investigación del grupo involucra la búsqueda de glicosidasas de interés en glicobiología en diversos microorganismos, su posterior purificación, caracterización, inmovilización y aplicación como herramienta biotecnológica en procesos de deglicosilación enzimática que permitan elucidar el rol de los glicanos en procesos biológicos de interés.

Uso del material genético de origen antártico para el desarrollo de productos biotecnológicos (industrias cosméticas, médica, biocombustibles, papelera, detergentes).

Inmunoterapia oncológica basada en el bloqueo de puntos de control. Modulación farmacológica del inflamasoma con pequeñas moléculas .

La desregulación del sistema inmune puede llevar a afectaciones crónicas que se conocen bajo el nombre de enfermedades inflamatorias inmuno-mediadas (EII). Las EII incluyen más de 80 entidades clínicas que llegan a afectar a cerca de 10% de la población en el mundo occidental. Entre ellas se encuentran las enfermedades autoinflamatorias y autoinmunes. La investigación básica está permitiendo caracterizar mecanismos fisiológicos encargados de controlar el desarrollo de respuestas inflamatorias y adaptativas mediadoras de efectos patológicos, y ese conocimiento es crítico para innovar a nivel de estrategias dirigidas al sistema inmune y para comprender el mecanismo de acción de drogas de uso corriente.

Nuestro grupo se interesa en el estudio de mecanismos celulares y moleculares que controlan el proceso inflamatorio y la respuesta inmune adaptativa. Nos focalizamos en la biología de células dendríticas (DCs), ya que constituyen una sub-población de leucocitos capaces de orquestar respuestas inmunes adaptativas efectoras, al tiempo que disponen de potentes estrategias capaces de regular el desarrollo del proceso inflamatorio y de la respuesta adaptativa. Nuestro trabajo intenta cubrir aspectos relevantes y originales a nivel de mecanismos moleculares buscando al mismo tiempo la pertinencia desde un punto de vista de salud humana.

En este marco, el laboratorio ha caracterizado los transportadores iónicos emergentes TORID-1 (Tmem176b) y TORID-2 (Tmem176a), que son reguladores críticos de la activación del inflamasoma NLRP3. La regulación del inflamasoma por TORID-1 ha mostrado ser relevante en la respuesta inmune anti-tumoral. Hemos caracterizado inhibidores farmacológicos de TORID-1 y TORID-2 que han sido caracterizados a nivel pre-clínico como prometedoras drogas anti-tumorales.

Estudio de las bases moleculares imperantes en la interacción planta-microorganismo

Las Enfermedades Mitocondriales son uno de los errores innatos del metabolismo más comunes, con una prevalencia estimada conservadora de 1:5000. Sin embargo, la medicina mitocondrial es una especialidad relativamente nueva y como consecuencia los médicos todavía poseen evidencia limitada para formular decisiones sobre el diagnóstico, pronóstico y tratamiento del paciente.

La gran variabilidad en el fenotipo clínico y la falta de biomarcadores sensibles y específicos, hacen que el diagnóstico de las Enfermedades Mitocondriales sea un verdadero desafío. Aún hoy, para su diagnóstico se requiere de una batería de estudios en distintos tejidos. Algunos estudios básicos pueden realizarse en nuestro medio y ayudan a plantear el diagnóstico ante cada caso concreto. Sin embargo, la falta de mayor número de herramientas diagnásticas hace que las familias transiten por un camino de incertidumbre con importante desgaste emocional y en algunos casos económico.

Este colectivo interdisciplinario, formado por médicos clínicos de distintas especialidades e investigadores básicos con formaciones diferentes apunta a mejorar la realidad actual del diagnóstico de las Enfermedades Mitocondriales en el Uruguay. Para esto propone generar ámbitos para: 1) la puesta a punto y desarrollo de herramientas de diagnóstico tanto a nivel genómico como funcional; 2) la investigación y formación de recursos humanos en el tema; 3) la evaluación centralizada y más completa de los pacientes.

Bioquímica oxidativa de lípidos, acidos grasos nitrados, óxido nítrico, inflamación, estrés nitrooxidativo, neurodegeneración, nutracéuticos, espectrometría de masa

Investigacion y Desarrollo de Vacunas e Inmunoterapias

Metabolismo de gusanos. Antihelmínticos.

Nuestro laboratorio investiga cómo los gusanos obtienen energía. Los gusanos parásitos o helmintos infectan a una cuarta parte de la población mundial. Ocho de las veinte enfermedades categorizadas por la OMS como desatendidas son causadas por helmintos, y los que provocan infecciones en el ganado y cultivos constituyen un importante problema económico para los países en desarrollo.

Para estos parásitos no hay vacunas disponibles, al tiempo que los antihelmínticos en uso no son eficaces para el ganado. Buscamos identificar los “punto de quiebre” del metabolismo de estos parásitos, de modo de imposibilitarles obtener energía.: en concreto, estamos estudiando el metabolismo que estos organismos usan en condiciones de hipoxia, como las encontradas en el tracto gastrointestinal de sus hospederos mamíferos. Además, establecimos ensayos de motilidad de organismo entero con el fin descubrir nuevos antihelmínticos que paralicen gusanos.

Nuestro laboratorio también investiga en biología del selenio, un micronutriente esencial para la mayoría de los organismos, incluyendo los mamíferos. Para la mayoría de nuestras investigaciones usamos el gusano C. elegans como modelo.

Genética/genómica de plantas

El Laboratorio desarrolla e implementa herramientas biotecnológicas y estrategias basadas en genética cuantitativa al servicio de los sistemas productivos más importantes de la región Este de Uruguay, con el fin de contribuir a su sustentabilidad ambiental y económica, inocuidad y agregado de valor.

En el área de mejoramiento genético de arroz se estudia la genética y genómica de los principales rasgos de interés (rendimiento, resistencia a enfermedades, inocuidad del grano, tolerancia a estreses abióticos). Se trabaja en la evaluación y aplicación de selección genómica en etapas tempranas para acelerar la ganancia genética en estos rasgos y el desarrollo de nuevos cultivares.

El uso de cultivares resistentes a herbicida trae aparejada la aparición de malezas resistentes. Hemos desarrollado y brindamos un servicio biotecnológico para el diagnóstico molecular de la resistencia a herbicidas en el arroz maleza que permite identificar focos en forma temprana, así como conocer la dinámica de la población de malezas en tiempo real y su relación con el manejo agronómico.

Estudio del metabolismo secundario volátil y no volátil en plantas y microorganismos.

Principales líneas de investigación:
Metabolismo volátil y no volátil en frutas nativas.

Metabolismo volátil y no volátil en uvas y vinos (quimica enologica).

Aplicación de técnicas cromatografías (GC, GC-O, GC-GC quiral, GC-MS, HPLC) a la química de productos naturales.

Ecofungicidas en poscosecha y transporte de frutas.

Glicobiología e Inmunología Tumoral.

La interacción entre las proteínas y los hidratos de carbono (azúcares) tiene un papel esencial en varios procesos celulares, como la proliferación y diferenciación celular, así como en diferentes enfermedades, incluyendo la infección por virus, bacterias y parásitos. Para esas funciones especializadas, algunos tipos de glúcidos se unen a proteínas formando estructuras complejas llamadas glicoproteínas, que se encuentran en la superficie de las células y que influyen en la comunicación celular. La glicobiología es una disciplina que estudia la estructura y función de los hidratos de carbono como entidades vinculadas a la función celular.

Nuestro laboratorio está enfocado a la identificación y estudio de algunas alteraciones de la glicosilación en el cáncer. La glicosilación alterada produce algunas estructuras que son específicas de tumores. Contra ellas generamos diferentes tipos de desarrollos biotecnológicos en vistas a su aplicación biomédica. Nuestras líneas de investigación están orientadas a comprender características de la biología tumoral y, especialmente, desarrollar nuevos procedimientos moleculares en vistas a su aplicación al diagnóstico y tratamiento de la enfermedad.

Estudio de las interacciones moleculares que intervienen en la regulación de la expresión génica mediante análisis teóricos y experimentales (bioquímico, molecular, fisicoquímico, genómico y bioinformático).

Principales líneas de investigación:
Interacciones ácidos nucleicos-proteína en Trypanosoma cruzi.

Análisis genómicos estructurales y funcionales en Trypanosomas y Leishmania.

Estudio de micro-ARN involucrados en el cáncer de próstata.

Estudios genéticos por NGS de cáncer de colon hereditario.

Estudio de los mecanismos moleculares de acción de quimioterápicos para tratamiento de parasitosis y cáncer.

El laboratorio de Virología Molecular (LVM) del Centro de investigaciones nucleares, Facultad de Ciencias, posee una vasta experiencia en el área de la Virología Molecular, en la cual trabaja desde el año 1995.

Presenta una importante trayectoria en el campo de la evolución viral, principalmente en el estudio del modo de evolución y variabilidad genética de virus cuyo genoma está constituido por ARN. Los mismos presentan tasas de mutación muy elevadas las cuales son principalmente conferidas por las ARN polimerasa dependiente de ARN (APdA) presentes en estos virus. Por consiguiente, una población de un virus ARN no se compone de una sola variante genética, sino de un conjunto de variantes virales estrechamente relacionadas genéticamente, denominadas cuasiespecies.

Nuestro objetivo es contribuir a comprender las bases moleculares de la variación viral, la dinámica poblacional de virus ARN, comprender el significado evolutivo de estos procesos, así como contribuir en el diseño de nuevas estrategias antivirales que contemplen la alta mutabilidad y adaptabilidad de estos virus.

Dentro de los que son los virus cuyo material genético está compuesto por ARN, nuestro laboratorio se ha centrado en el estudio de viriosis emergentes como son el Dengue e Influenza, así como al estudio del Virus causantes de enfermedades Hepáticas como son los virus de la hepatitis A, B y C.

RNAi como una alternativa al uso de pesticidas en el control de chinches de la soja.

Se propone utilizar el potencial de la interferencia de RNA (RNAi) como un insecticida no modificado genéticamente. Las formulaciones basadas en RNA son altamente específicas y no se espera que tengan efectos perjudiciales en otras especies de insectos benéficas como polinizadores (abejas melíferas), predadores y parasitoides de huevos. Se plantea identificar genes candidatos y formular RNA bicatenario resistente a la degradación por nucleasas, un obstáculo clave para el uso efectivo de RNAi. Se evaluará su capacidad de inducir letalidad en chinches y se pondrá a punto el escalado para su evaluación a campo.


Efecto del receptor EFR en germoplasma avanzado de papa para la resistencia a la marchitez bacteriana.

El receptor de Arabidopsis thaliana (At) EFR reconoce el factor de elongación Tu (EF-Tu), un patrón molecular asociado a patógenos (PAMP) conservado en bacterias y asociado a la respuesta inmune mediada por PAMPs (PTI). Nuestro grupo de trabajo evalúa la expresión de AtEFR en un cultivar de papa susceptible (INIA-Iporá) y en un clon avanzado del programa de mejoramiento (09509.6) con resistencia parcial por introgresión de genes desde S. commersonii. La evaluación se realiza a nivel bioquímico-molecular y verificar si el efecto de la modificación genética en términos de inmunidad significa un costo para la planta.


Estrategias moleculares para implementar la resistencia al hongo Claviceps paspali en Paspalum dilatatum cv ‘Estanzuela Chirú’.

Paspalum dilatatum cv Estanzuela Chirú es una gramínea perenne de ciclo estival con alta calidad forrajera presente en el campo natural. Tiene una alta productividad y eficiencia de uso de agua y nitrógeno, así como buena adaptación a pastoreo intenso. Sin embargo, su uso se ha visto limitado dada su susceptibilidad a Claviceps paspali. El proyecto busca evaluar estrategias moleculares para implementar la resistencia mediante el análisis de genes involucrados en la interacción Paspalum y Claviceps. Se
ha estudiado la expresión génica a nivel del estigma/estilo de la flor en Chirú con el fin de identificar genes diferencialmente expresados tras la infección del hongo y su posible rol en la interacción planta-patógeno.


RNAi como una alternativa al uso de pesticidas en el control de chinches de la soja.

Se propone utilizar el potencial de la interferencia de RNA (RNAi) como un insecticida no modificado genéticamente. Las formulaciones basadas en RNA son altamente específicas y no se espera que tengan efectos perjudiciales en otras especies de insectos benéficas como polinizadores (abejas melíferas), predadores y parasitoides de huevos. Se plantea identificar genes candidatos y formular RNA bicatenario resistente a la degradación por nucleasas, un obstáculo clave para el uso efectivo de RNAi. Se evaluará su capacidad de inducir letalidad en chinches y se pondrá a punto el escalado para su evaluación a campo.

Implementación de herramientas moleculares (genotipado, mejoramiento asistido por marcadores, retrocruzamientos asistidos por marcadores, mapeo genético para identificación de QTL y genes candidatos) para estudios de diversidad y para incrementar la ganancia genética y acelerar los ciclos de selección en programas de mejoramiento genético de cultivos (soja, trigo y cebada) y vid.

Nos enfocamos en el estudio de la microbiología de sistemas de tratamiento de efluentes, en la utilización de sistemas electroquímicos microbianos para la producción de energía eléctrica, y en procesos de biorremediación.

La principal área temática del grupo es en la búsqueda de nuevos agentes antimicrobianos y antibiofilm y sus aplicaciones biotecnológicas (en las áreas de salud, alimentos, protección vegetal, desarrollo de materiales). Dentro de esta área se trabaja en dos líneas principales: una en Nanotecnología, basada en la síntesis biológica de nanopartículas, y otra en la bioprospección de productos naturales (de microorganismos o vegetales).

Grupo interdisciplinario del estudio de especies forestales y forrajeras, desde las disciplinas de Genética, Biología Molecular, Fisiología, Bioquímica, Microbiología.

Calidad e inocuidad de agroalimentos. Efectos de las prácticas agropecuarias, genéticas y ambientales en la composición de los alimentos.Aptitud agroindustrial y nutricional. Nutracéuticos y estreses ambientales. Métodos moleculares de evaluación de calidad e inocuidad de los alimentos.

Uso de microorganismos para la agricultura.

Principales líneas de investigación:
INIA dispone de una colección de cepas microbianas con potencial uso para biofertilización y control biológico de insectos plaga y enfermedades. Estas cepas representan el capital para el desarrollo de insumos biológicos, en función de las demandas priorizadas:

• Fijación biológica de nitrógeno en cultivos y especies forrajeras.

• Desarrollo de biofertilizantes en base a microorganismos solubilizadores de fósforo.

• Desarrollo de inoculantes en base a microorganismos supresores de enfermedades de implantación.

• Desarrollo de biocontroladores fúngicos para isocas y otros insectos de suelo.

• Formulación de hongos entomopatógenos de uso foliar para el control biológico de insectos picosuctores como mosca blanca, pulgones y chinches.

• Identificación de compuestos bioactivos para el control de enfermedades poscosecha.

• Evaluación de sistemas de escalado mediante producción en micro-fábricas celulares o empleando a las plantas como biorreactores.

El Programa de Tecnología Molecular, Celular y Animal (ProTeMCA) tiene como misión integrar el conocimiento y capacidades tecnológicas de distintos grupos del Institut Pasteur de Montevideo para promover el desarrollo de investigación y tecnología innovadora en el área de la ingeniería genética, bioensayos y modelos basados en proteínas, células o animales.

Con énfasis en la vinculación del conocimiento científico y su aplicación, a través de la interacción dinámica con la academia y la industria, el programa busca contribuir a resolver problemas en el área de la biotecnología a través de nuevas herramientas, productos, procesos o servicios. En esa tarea colabora también con grupos de investigación o entidades privadas para desarrollar tecnologías moleculares que tiendan al mejoramiento de (bio) fármacos, células o animales.

Estudio de vías de señalización celular mediadas por fosfatasas de patógenos intracelulares. Búsqueda de marcadores proteicos de estrés o infección.

Epidemiología molecular de Salmonella enterica, con énfasis en el serovar Enteritidis. Mecanismo molecular de la salmonelosis invasiva, con énfasis en el serovar Dublin. Vacunas polivalentes para aplicación en animales de producción.

Principales líneas de investigación:
Biología celular, molecular y bioquímica de parásitos.

Plegamiento in vivo de proteínas.

Biotecnología. Sistemas de detección molecular.

Producción de proteínas recombinantes.

Biología molecular de la gametogénesis masculina.

Trazabilidad molecular alimentaria. Análisis del ADN remanente en alimentos para identificación de especies animales y vegetales presentes en los mismos. Análisis de transgenicidad de cultivares y alimentos de consumo masivo.

Metagenómica ambiental.

Estudio de tirosin fosfatasas de patógenos intracelulares.

Enzimas microbianas de interés tecnológico.

Bioquímica y biología molecular de Aspergilus nidulans.

Mecanismos bacterianos de adaptación al frío.
Estructura y función de proteínas de unión a ácidos grasos.

Principales líneas de investigación:
Estudio de hongos fitopatógenos que afectan cultivos (forestales, frutícolas, hortícolas y extensivos).

Comunidades de hongos presentes en granos y micotoxinas.

Hongos como agentes de control biológico de enfermedades y plagas de plantas.

Hongos descomponedores de madera.

Principales líneas de investigación:
Variabilidad y evolución de virus ARN.


Expresión de genes utilizando vectores virales.

Virus emergentes: robovirus y arbovirus.

Reservorios y vectores. Caracterización molecular.

Epidemiología molecular y estudio ambiental de virus entéricos.

Bases moleculares de mosquitos vectores de virus.

Estudios genómicos y proteómicos de parapoxvirus.

Estudio de compuestos con capacidad antiviral.

Bioinformática, Genómica.

La bioinformática es la aplicación de técnicas computacionales y estadísticas para el análisis datos de origen biológico, que incluye también su organización y almacenamiento así como el desarrollo de herramientas para manejarlos.

El volumen de datos generado actualmente por las técnicas de secuenciación promueve un desarrollo constante de métodos para lidiar de manera eficiente con numerosos genomas/proteomas, sin perder de vista los datos biológicamente relevantes.

En nuestra Unidad aplicamos variadas herramientas al estudio comparativo de genomas a escala global, así como familias específicas de genes y proteínas. Históricamente nos hemos focalizado en bacterias, patógenos humanos y el genoma humano. También hemos desarrollado herramientas específicas para lidiar con los nuevos desafíos metodológicos planteados por la explosión de información. Estas aplicaciones y desarrollos tienen cabida en genética y biomedicina, y en la más reciente metagenómica, la caracterización genómica de muestras ambientales, pudiendo ser el ambiente un curso de agua o la mejilla interna de un individuo.

Espectrometría de masa-Proteómica.

Los objetivos de la Unidad de Bioquímica y Proteómica Analíticas —un grupo mixto entre el IP Montevideo y el Instituto de Investigaciones Biológicas Clemente Estable (IIBCE)— son realizar y apoyar proyectos de investigación biomédica basados en espectrometría de masas (EM) y proteómica; ofrecer capacitación, asistencia científica y acceso a tecnologías proteómicas basadas en EM a la comunidad científica local; y contribuir a los programas locales y regionales de educación en esta área.

Durante los últimos años, la Unidad incorporó espectrómetros de masas y desarrolló el know-how para expandir la calidad y el tipo de procedimientos analíticos disponibles. Actualmente, nuestro portafolio analítico incluye estrategias proteómicas cuantitativas y comparativas de tipo “shotgun”, así como estrategias basadas en geles, estudios interactómicos in vivo e in vitro, y análisis de modificaciones postraduccionales de proteínas.

El trabajo de investigación de nuestro grupo se centra en el estudio de los mecanismos de señalización en micobacterias utilizando enfoques proteómicos, con énfasis en el análisis de fosforilación de proteínas. En particular nos interesa comprender algunos procesos claves para las micobacterias patógenas como Mycobacterium tuberculosis, y que están relacionados a su capacidad de sobrevivir dentro del hospedero.

Bebidas fermentadas. Microorganismos participantes de la fermentación alcohólica. Metabolismo de levaduras. Selección de levaduras nativas. Procesos fermentativos. Estudio de aromas